歷年組織調整
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組織調整
民國9年
民國9年9月，日台灣總督田鍵治郎氏將澎湖島廳改為郡，隸屬高雄州，郡設郡守，郡役所設兩課辦事，第一課辦理庶務行政，第二課掌理警務，郡下設街庄，辦理普通行政機關，另郡下之警察分室，係屬於警察業務系統，澎湖僅設望安分室一處，其餘地區警察業務由警察直轄。
民國15年
民國15年7月，澎湖改設廳，廳下設警務課負責警務，下設馬公、望安支廳。
民國36年
民國36年4月縣政府警察科改為警察局，將原馬公、望安支廳改為警察所。
民國37年
成立望安警察分局，設有七美、東垵、水垵、將軍、嶼坪、雙吉及花嶼等7個分駐、派出所，並設花宅、西吉及西嶼坪3個駐在所，計19個警勤區。
民國58年
實施戶警合一制度，戶政事務所歸併警察局，戶政事務所主任兼任副分局長。
民國62年
民國62年分局業務組由5組改為6組（行政、督察、刑事、戶口、保安、保防），分局員增至6人，各組設分局員1人。
民國67年
配合西吉村遷村，民國67年7月16日西吉駐在所裁撤。
民國67年
分局舊建物於民國67年9月間拆除重建，68年7月30日峻工啟用
民國70年
雙吉派出所建於70年9月24日。
民國71年
七美分駐所建於71年6月17日
民國73年
嶼坪派出所建於73年9月14日。
民國73年
七美分駐所73年9月21日增建二樓。
民國73年5月
奉台灣省政府核定分局設4組辦事，另增設勤務組，原分局員改稱組長，各組均設組長1人，巡官、辦事、雇員若干人，勤務組除組長外並設置巡佐、警員3至7人。分駐所置所長1人、巡佐、警員若干人；全縣計設置警勤區97個（馬公分局83個、望安分局14個）。
各組職掌如下：
第一組：掌理行政、交通、經濟、外事、總務、會計等事項。
第二組：掌理督察、保安、民防、人事事項。
第三組：掌理刑事、違警、拘留所等事項。
第四組：掌理保防、戶口、後備軍人名集、入出境管理事項。
民國76年
民國76年7月15日政府頒訂『國家安全法』，警察機關接任漁港安檢工作，自77年11月8日陸續增設望安、將軍、七美漁港派出所，及東安、土地公港、中社、水垵、東與坪、西嶼坪、雙吉、花嶼、烏溝、頂隙、潭子等漁港駐在所，於民國89年2月15日，因法令修改，安檢工作移交海巡署。
民國79年
將軍派出所建於79年11月23日
民國80年
花嶼派出所建於80年8月10日
民國81年
民國81年07月01日實施戶警分立，附屬分局之戶政事務所回歸縣政府民政局，副分局長職務原由戶政事務所主任兼任，民國82年2月正式納入編制專任，分局增設副分局長職務乙名、官等為警正三階，官階為二線二星。
民國81年
分局68年7月30日峻工啟用，原為二層樓，後因組織編制修改及員警增加，不敷使用，乃於81年12月18日增建三樓，維持迄今。
民國85年
望安、七美消防小隊，於85年間因訂定消防法，警消分立。
民國89年
國89年12月01日分局（屬乙種縣沿海分局）各組業務職掌調整如下：
第一組掌理行政、交通、戶口、外事鄉、會計等業務事項。
第二組掌理督察、訓練、人事等業務事項。
第三組掌理刑事、少年等業務事項。
第四組掌理保安、民防等業務事項。
第五組掌理資訊、秘書、公共關係、後勤等業務事項。
第六組掌理保防 、陸務等業務事項。
勤務指揮中心掌理勤務指揮、管制、聯絡等業務事項。
警備隊轄區巡邏及治安維護等事項。
民國91年
民國91年07月01日分局（屬乙種縣沿海分局）各組業務調整如下：
第一組掌理行政、戶口、外事、會計、秘書、公共關係、後勤等業務事項。
第五組掌理交通、資訊等業務事項。餘各組掌理業務事項不變。
民國91年
於民國91年10月15日，因西嶼坪村人口外流嚴重（僅住6人），乃與嶼坪派出所合署辦公。
民國92年
民國92年12月1日分局長官等自警正二階提升為警正一階，屬五序列，官階由二線三星提升為二線四星。副分局長官等自警正三階提升為警正二階，屬六序列，官階由二線二星提升為二線三星。
民國92年
民國92年12月1日組長、所長（組員兼）等官等自警正四階提升為警正三階，屬八序列，官階由原二線一星提升為二線二星。偵查員（一）、巡官等官等自警正四階提升為警正三階，屬九序列，官階由原一線四星提升為二線一星。巡佐、小隊長官等自警佐二階提升為警佐二階至警正四階，屬十序列，官階由原一線三星提升為一線四星。警員、偵查員（二）官等自警佐三階提升為警佐三階至警正四階，屬十一序列，官階由原一線二星提升為一線三星。
民國94年
民國94年7月1日刑事警察隊改為刑事警察大隊，其所屬偵查員均改為偵查佐，官等自警佐三階至警正四階提升為警佐二階至警正四階，官階由原一線三星提升為一線四星。
民國94年
民國94年9月1日分局（屬乙種縣沿海分局）各組業務調整如下：
第一組掌理行政、戶口、外事、會計、秘書、公共關係、後勤、庶務、陸務等事項。（設組長)
第二組掌理督察、訓練、人事、政風等業務事項。（設組長)
第三組掌理保安、民防、民防管制、保防等業務。（設組長）
第四組掌理交通、資訊等業務。（設組長）
勤務指揮中心掌理勤務指管、通訊、聯絡事宜。（設主任）
偵查隊掌理刑事、少年、婦幼、鑑識等業務。（設隊長、副隊長)
警備隊擔任機動警力及各項警力支援事項。（設隊長、副隊長）
交通分隊掌理交通秩序整理、違規取締及交通事故處理事項。（設分隊長、小隊長）
民國90年
水垵派出所舊廳舍於90年11月拆除，於91年3月27日峻工使用，92年3月18日舉行落成啟用。
民國102年
水垵派出所於102年7月1日配合警力運作方案奉准裁撤。
民國9年9月，日台灣總督田鍵治郎氏將澎湖島廳改為郡，隸屬高雄州，郡設郡守，郡役所設兩課辦事，第一課辦理庶務行政，第二課掌理警務，郡下設街庄，辦理普通行政機關，另郡下之警察分室，係屬於警察業務系統，澎湖僅設望安分室一處，其餘地區警察業務由警察直轄。
民國15年
民國15年7月，澎湖改設廳，廳下設警務課負責警務，下設馬公、望安支廳。
民國36年
民國36年4月縣政府警察科改為警察局，將原馬公、望安支廳改為警察所。
民國37年
成立望安警察分局，設有七美、東垵、水垵、將軍、嶼坪、雙吉及花嶼等7個分駐、派出所，並設花宅、西吉及西嶼坪3個駐在所，計19個警勤區。
民國58年
實施戶警合一制度，戶政事務所歸併警察局，戶政事務所主任兼任副分局長。
民國62年
民國62年分局業務組由5組改為6組（行政、督察、刑事、戶口、保安、保防），分局員增至6人，各組設分局員1人。
民國67年
配合西吉村遷村，民國67年7月16日西吉駐在所裁撤。
民國67年
分局舊建物於民國67年9月間拆除重建，68年7月30日峻工啟用
民國70年
雙吉派出所建於70年9月24日。
民國71年
七美分駐所建於71年6月17日
民國73年
嶼坪派出所建於73年9月14日。
民國73年
七美分駐所73年9月21日增建二樓。
民國73年5月
奉台灣省政府核定分局設4組辦事，另增設勤務組，原分局員改稱組長，各組均設組長1人，巡官、辦事、雇員若干人，勤務組除組長外並設置巡佐、警員3至7人。分駐所置所長1人、巡佐、警員若干人；全縣計設置警勤區97個（馬公分局83個、望安分局14個）。
各組職掌如下：
第一組：掌理行政、交通、經濟、外事、總務、會計等事項。
第二組：掌理督察、保安、民防、人事事項。
第三組：掌理刑事、違警、拘留所等事項。
第四組：掌理保防、戶口、後備軍人名集、入出境管理事項。
民國76年
民國76年7月15日政府頒訂『國家安全法』，警察機關接任漁港安檢工作，自77年11月8日陸續增設望安、將軍、七美漁港派出所，及東安、土地公港、中社、水垵、東與坪、西嶼坪、雙吉、花嶼、烏溝、頂隙、潭子等漁港駐在所，於民國89年2月15日，因法令修改，安檢工作移交海巡署。
民國79年
將軍派出所建於79年11月23日
民國80年
花嶼派出所建於80年8月10日
民國81年
民國81年07月01日實施戶警分立，附屬分局之戶政事務所回歸縣政府民政局，副分局長職務原由戶政事務所主任兼任，民國82年2月正式納入編制專任，分局增設副分局長職務乙名、官等為警正三階，官階為二線二星。
民國81年
分局68年7月30日峻工啟用，原為二層樓，後因組織編制修改及員警增加，不敷使用，乃於81年12月18日增建三樓，維持迄今。
民國85年
望安、七美消防小隊，於85年間因訂定消防法，警消分立。
民國89年
國89年12月01日分局（屬乙種縣沿海分局）各組業務職掌調整如下：
第一組掌理行政、交通、戶口、外事鄉、會計等業務事項。
第二組掌理督察、訓練、人事等業務事項。
第三組掌理刑事、少年等業務事項。
第四組掌理保安、民防等業務事項。
第五組掌理資訊、秘書、公共關係、後勤等業務事項。
第六組掌理保防 、陸務等業務事項。
勤務指揮中心掌理勤務指揮、管制、聯絡等業務事項。
警備隊轄區巡邏及治安維護等事項。
民國91年
民國91年07月01日分局（屬乙種縣沿海分局）各組業務調整如下：
第一組掌理行政、戶口、外事、會計、秘書、公共關係、後勤等業務事項。
第五組掌理交通、資訊等業務事項。餘各組掌理業務事項不變。
民國91年
於民國91年10月15日，因西嶼坪村人口外流嚴重（僅住6人），乃與嶼坪派出所合署辦公。
民國92年
民國92年12月1日分局長官等自警正二階提升為警正一階，屬五序列，官階由二線三星提升為二線四星。副分局長官等自警正三階提升為警正二階，屬六序列，官階由二線二星提升為二線三星。
民國92年
民國92年12月1日組長、所長（組員兼）等官等自警正四階提升為警正三階，屬八序列，官階由原二線一星提升為二線二星。偵查員（一）、巡官等官等自警正四階提升為警正三階，屬九序列，官階由原一線四星提升為二線一星。巡佐、小隊長官等自警佐二階提升為警佐二階至警正四階，屬十序列，官階由原一線三星提升為一線四星。警員、偵查員（二）官等自警佐三階提升為警佐三階至警正四階，屬十一序列，官階由原一線二星提升為一線三星。
民國94年
民國94年7月1日刑事警察隊改為刑事警察大隊，其所屬偵查員均改為偵查佐，官等自警佐三階至警正四階提升為警佐二階至警正四階，官階由原一線三星提升為一線四星。
民國94年
民國94年9月1日分局（屬乙種縣沿海分局）各組業務調整如下：
第一組掌理行政、戶口、外事、會計、秘書、公共關係、後勤、庶務、陸務等事項。（設組長)
第二組掌理督察、訓練、人事、政風等業務事項。（設組長)
第三組掌理保安、民防、民防管制、保防等業務。（設組長）
第四組掌理交通、資訊等業務。（設組長）
勤務指揮中心掌理勤務指管、通訊、聯絡事宜。（設主任）
偵查隊掌理刑事、少年、婦幼、鑑識等業務。（設隊長、副隊長)
警備隊擔任機動警力及各項警力支援事項。（設隊長、副隊長）
交通分隊掌理交通秩序整理、違規取締及交通事故處理事項。（設分隊長、小隊長）
民國90年
水垵派出所舊廳舍於90年11月拆除，於91年3月27日峻工使用，92年3月18日舉行落成啟用。
民國102年
水垵派出所於102年7月1日配合警力運作方案奉准裁撤。
